4 грудня 2015 року детективи НАБУ розпочали розслідування кримінального провадження, передбаченого ч.5 ст.191 КК України, за фактом привласнення службовими особами в особливо великих розмірах майна ВАТ «Запоріжжяобленерго» (01.02.2017 назву товариства змінено на Публічне акціонерне товариство (ПАТ) «Запоріжжяобленерго»).
Наприкінці 2015 року НАБУ розпочало розслідування кримінального провадження за фактом зловживання службовим становищем посадовими особами Державної авіаційної служби (ДАС) з метою одержання неправомірної вигоди для окремих приватних авіаперевізників, що спричинило тяжкі наслідки державним інтересам (ч.2 ст. 364 КК України).
На підставі звернення народного депутата Віталія Купрія 25 грудня 2015 року детективи НАБУ розпочали досудове розслідування за фактом незаконного збагачення Військового прокурора сил АТО. Протягом січня-травня 2016 року у Києві та Харкові проводилися слідчі дії. У рамках розслідування неодноразово проводилися допити цивільної дружинипрокурора. Зібравши докази, 23 травня директор НАБУ Артем Ситник направив керівнику САП на погодження письмове повідомлення про підозру військовому прокурору у вчиненні кримінального правопорушення, передбаченого ч.2 ст.368-2 КК України.
У березні 2016 року НАБУ розпочало розслідування за фактом розтрати коштів ВАТ «Одеський припортовий завод», 100% акцій якого належать державі. Вже через чотири місяці детективи НАБУ спільно з прокурорами САП затримали перших підозрюваних. 14 липня було затримано першого заступника голови правління НАК «Нафтогаз України», члена Наглядової ради ПАТ «Укрнафта» та голову Наглядової ради ПАТ «Одеський припортовий завод» (ПАТ «ОПЗ») і першого заступника директора та першого заступника голови правління ПАТ «ОПЗ».